Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms