Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms