Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms