Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPIAP49247 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPIAP49247 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPIAP49247 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms