Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC26A3P40879 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms