Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms