Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms