Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms