Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms