Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms