Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms