Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFMP07197 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFMP07197 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFMP07197 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFMP07197 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFMP07197 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFMP07197 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFMP07197 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFMP07197 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFMP07197 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFMP07197 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFMP07197 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFMP07197 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFMP07197 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms