Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms