Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN2BO60939 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms