Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms