Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD28O15084 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms