Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms