Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS4AQ9UN37 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VPS4AQ9UN37 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms