Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms