Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP68Q9UHB9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms