Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms