Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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