Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms