Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms