Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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