Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms