Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms