Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG7P83436 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG7P83436 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG7P83436 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG7P83436 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms