Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBBP68871 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms