Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNPDA1P46926 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms