Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms