Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms