Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLIM4O00461 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms