Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms