Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms