Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD5Q99717 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms