Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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C2orf48Q96LS8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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C2orf48Q96LS8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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C2orf48Q96LS8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf48Q96LS8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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