Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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CLIP4Q8N3C7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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CLIP4Q8N3C7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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CLIP4Q8N3C7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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CLIP4Q8N3C7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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CLIP4Q8N3C7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP4Q8N3C7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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