Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms