Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms