Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms