Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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COL5A1-AS1Q5SY13 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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COL5A1-AS1Q5SY13 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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COL5A1-AS1Q5SY13 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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