Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms