Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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IRF5Q13568 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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IRF5Q13568 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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IRF5Q13568 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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IRF5Q13568 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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IRF5Q13568 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF5Q13568 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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