Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ITGB3BPQ13352 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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ITGB3BPQ13352 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ITGB3BPQ13352 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ITGB3BPQ13352 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ITGB3BPQ13352 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ITGB3BPQ13352 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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ITGB3BPQ13352 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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ITGB3BPQ13352 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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