Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms