Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms