Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MC1RQ01726 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms