Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms