Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms